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患者来源的异种移植(PDX)模型是将患者样本植入免疫缺陷小鼠体内,该模型在重现癌症特征方面表现出显著优势。经过优化的PDX建模流程以及现代技术的应用,使PDX模型成为癌症治疗研究中的理想选择,例如新药的临床前试验、新型药物组合的验证、药物敏感性患者的筛选以及耐药机制的探索。
百奥赛图已成功建立270个PDX模型,其中包括13种癌症类型。
Experienced in ADC evaluation | Immune reconstitution | High quality PDX from vendors | Gene expression database | Live PDX animal |
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Types of cancer | Model quantity | TMA quantity |
Breast | 12 | 1 |
Colorectal | 13 | 2 |
Esophagus | 10 | 1 |
Gastric | 144 | 13 |
Lung | 22 | 3 |
Pancreatic | 34 | 4 |
Ampullary | 1 | 1 |
Targets tested by IHC | |||||
HER2 | CDCP1 | 5T4 | EPHA2 | CLDN18.2 | LYPD3 |
MSLN | HER3 | PTK7 | ADAM9 | TIM1 | PSCA |
MUC16 | EGFR | ITGB6 | B7-H3 | SLC34A2 | KREMEN2 |
TPBG | MET | MUC1 | B7-H4 | CD71 | CD228 |
FOLR1 | EPCAM | TROP2 | GPC1 | CDH3 | MUC18 |
Model ID | BP0508 |
Cancer type | Lung cancer |
Rating scale | 3+ |
Generation | R5P4 |
Biocytogen的PDX Seq数据库
Model ID | Subtype analysis | Gender/Age | Sample Location | Type of deregulations | TNM | CLDN18.2/EGFR | Sequencing |
BP0062 | Ductal Adenocarcinoma | F/61 | Pancreaticoduodenal | Moderately differentiated | IV | positive | WES |
HLA-A | HLA-B | HLA-C | HLA-DPA1 | HLA-DPB1 | HLA-DQA1 | HLA-DQB1 | HLA-DRA | HLA-DRB1 | HLA-DRB3 | HLA-DRB4 | |
BP0062-P0 | 02:242 | 40:06 | 08:01 | 02:02 | 05:01 | 01:02 | 06:02 | 01:01 | 15:01 | 01:01 | 01:01 |
01:215 | 37:01 | 06:138 | 01:03 | 22:01 | 04:01 | 03:01 | 07:01 | 02:02 |
STR确认
Genetic Site | BP0062-P1 | BP0062-P5 | ||
Amelogenin | X | X | X | X |
CSF1PO | 10 | 12 | 10 | 12 |
D13S317 | 10 | 10 | ||
D16S539 | 9 | 12 | 9 | 12 |
D5S818 | 11 | 11 | ||
D7S820 | 9 | 12 | 9 | 12 |
TH01 | 9 | 9 | ||
TPOX | 8 | 11 | 8 | 11 |
vWA | 12 | 17 | 12 | 17 |
D21S11 | 30 | 32.2 | 30 | 32.2 |
根据ANSI国际标准,当细胞系的匹配度≥80%时,视为相关。结果显示,这些样本的匹配度为100%,且来自同一患者。
BP0062被皮下植入B-NDG小鼠。肿瘤体积使用公式V=0.5a X b2计算,其中a和b分别为肿瘤的长径和短径。数据以平均值±SEM表示。
结果:来自胰腺癌的PDX模型BP0062在B-NDG小鼠中成功建立。可以有效追踪肿瘤体积。
患者来源的异种移植模型能够重现原始患者样本的结构,并在不同代次中保持相似的异质性。
对CLDN18.2和EGFR的IHC评估表明,不同代次的个体肿瘤之间没有明显的异质性。
Her2 x Trop2 ADC在Her2/Trop2高表达和低表达的PDX模型中表现出显著的肿瘤生长抑制。
与母本单抗ADC和对照ADC相比,BsADC在HER2低表达的非小细胞肺癌(NSCLC)PDX模型中表现出强大且持久的抗肿瘤活性,表明BsADC具有克服由肿瘤异质性引起的单靶ADC耐药的强大治疗潜力。
Model ID | Subtype | Information about patient | Growth curve | Pn≥3 | STR analysis | HLA | WES | RNA-Seq | In vivo study |
BP2010 | AML-M5 | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ |
BP2035 | AML-M2 | √ | √ | √ | √ | √ | |||
BP2053 | B-ALL | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ | |
BP2055 | B-ALL | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ |
BP2075 | B-ALL | √ | √ | √ | √ | √ | |||
BP2084 | T-ALL | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ |
BP2088 | B-ALL | √ | √ | √ | √ | √ | √ | ||
BP2094 | B-ALL | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ | |
BP2097 | B-ALL | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ | |
BP2101 | B-ALL | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ |
BP2103 | AML-M4 | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ | √ |
BP2117 | AML FLT3+ | √ | √ | √ | √ | √ |
Model ID | Subtype analysis | Gender/Age | Source type | Immunophenotyping | Fusion gene | SNV |
BP2010 | Relapse refractory AML-M5 | F/60 | Peripheral Blood | Express: HLA-DR (85.6%), CD34 (85.8%), CD13 (72.3%), CD33 (87.5%), CD117 (88.4%), CD64 (56%), CD38 (99.5%); Not express: CD10, CD19, CD20, CD22, CD2, CD3, CD4, CD5, CD7, CD8, CD14, CD15, CD11b, CD56, MPO, cCD79a,cCD3 |
MLL-AF6 positive | NRAS Q61R Mutation positive |
HLA-A | HLA-B | HLA-C | HLA-DPA1 | HLA-DPB1 | HLA-DQA1 | HLA-DQB1 | HLA-DRA | HLA-DRB1 | HLA-DRB4 | |
BP2010 | 29: 01 | 07: 05 | 15: 05 | 01: 03 | 03: 01 | 01: 02 | 06: 02 | 01: 01 | 15: 01 | 01: 01 |
26: 01 | 48: 05 | 02: 140 | 03: 01 | 02: 02 | 03: 01 | 03: 01 | 04: 07 |
STR确认
Genetic Site | BP2010-PA | BP2010-P9 | ||
Amelogenin | X | X | X | X |
CSF1PO | 12 | 12 | 12 | 12 |
D13S317 | 8 | 11 | 8 | 11 |
D16S539 | 10 | 11 | 10 | 11 |
D5S818 | 9 | 11 | 9 | 11 |
D7S820 | 10 | 13 | 10 | 13 |
TH01 | 9 | 9 | 9 | 9 |
TPOX | 8 | 11 | 8 | 11 |
vWA | 14.2 | 15.2 | 15 | 16 |
D21S11 | 29 | 29 | 29 | 29 |
根据ANSI设立的国际标准,当细胞系的匹配度≥80%时,认为它们是相关的。结果显示,这些样本具有100%的匹配度,且来自同一患者。
细胞表型确认
发现患者来源的异种移植模型能够在不同代次中再现免疫表型。
BP2010通过静脉注射到B-NDG小鼠体内。通过流式细胞术分析血液样本中的hCD45百分比。每周测量两次体重。数据以平均值±SEM表示。
结果:来自白血病PDX模型BP2010在B-NDG小鼠中成功建立,能够有效追踪hCD45百分比。
当hCD45 > 10%时,治疗组未见显著效果;当10% > hCD45 > 1%时,治疗组的肿瘤抑制效果显著。
结论:在给药期间的建模程度对小分子药物的疗效有较大影响。
FLT3靶向药物在B-NDG小鼠中的抗肿瘤活性。(A) 分子靶向小分子抗癌药物对B-NDG小鼠中的BP2010肿瘤生长的抑制作用较弱。通过尾静脉将BP2010的PDX模型接种到B-NDG小鼠中(雌性,n=6)。当外周血中的hCD45阳性细胞约达到10%时,小鼠分组并进行药物治疗,药物和治疗方案见(B)体重变化。数据以平均值±SEM表示。
抗体在B-NDG小鼠中的抗肿瘤活性。(A) BP2010肿瘤细胞表面高度表达人类CD47。(B) 抗体CD47-Hu5F9能够抑制BP2010在B-NDG小鼠中的肿瘤生长。通过尾静脉将BP2010的PDX模型接种到B-NDG小鼠中(雌性,n=7)。当外周血中的hCD45阳性细胞约达到1%时,小鼠分组并进行抗体药物治疗,治疗方案见(C)体重变化。数据以平均值±SEM表示。